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鄧宏魁團隊獲重要突破,相關(guān)成果有望用于治療重大疾病

2022/05/18    信息來源:   作者:    編輯:王道琳

日前,北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、北大-清華生命聯(lián)合中心鄧宏魁研究團隊在國際學(xué)術(shù)期刊Nature雜志在線發(fā)表了題為Chemical reprogramming of human somatic cells to pluripotent stem cells的研究論文,首次在國際上報道了使用化學(xué)小分子誘導(dǎo)人成體細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)槎酀撃芨杉?xì)胞這一突破性研究成果。

運用化學(xué)小分子重編程細(xì)胞命運(化學(xué)重編程),是繼“細(xì)胞核移植”和“轉(zhuǎn)錄因子誘導(dǎo)”之后新一代的,由我國自主研發(fā)的人多潛能干細(xì)胞制備技術(shù),為我國干細(xì)胞和再生醫(yī)學(xué)的發(fā)展解決了底層技術(shù)上的“瓶頸”問題。

未來有望用于治療糖尿病、重癥肝病、惡性腫瘤等重大疾病。


細(xì)胞分化何以逆轉(zhuǎn)?

多潛能干細(xì)胞具有無限增殖的特性和分化成生物體所有功能細(xì)胞類型的能力,這些神奇的特質(zhì)使其在細(xì)胞治療、藥物篩選和疾病模型等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價值,是再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最為關(guān)鍵的“種子細(xì)胞”。在哺乳動物自然發(fā)育過程中,多潛能干細(xì)胞只短暫存在于胚胎發(fā)育的早期階段,隨后便會分化為構(gòu)成生物體的各種類型的成體細(xì)胞,喪失其“種子細(xì)胞”的特性。

如何逆轉(zhuǎn)這一自然發(fā)育過程,使高度分化的成體細(xì)胞重新獲得類似胚胎發(fā)育早期的多潛能狀態(tài),一直是干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最重要的科學(xué)問題之一。

上世紀(jì)60年代,英國科學(xué)家John Gurdon在爪蟾中開發(fā)了細(xì)胞核移植技術(shù),1997年Ian Wilmut團隊利用該技術(shù)制備了克隆羊多莉,證明了哺乳動物高度分化的體細(xì)胞也可以被逆轉(zhuǎn)為早期胚胎的初始狀態(tài),并獲得了發(fā)育為整個動物個體的能力。2006年,日本科學(xué)家Shinya Yamanaka報道了使用轉(zhuǎn)基因的方式可以將小鼠成體細(xì)胞重編程為多潛能干細(xì)胞,稱為誘導(dǎo)多潛能干細(xì)胞(induced pluripotent stem cell,iPS細(xì)胞)。細(xì)胞核移植和導(dǎo)入外源基因的方法,證明了哺乳動物體細(xì)胞可以通過重編程逆轉(zhuǎn)為胚胎發(fā)育早期狀態(tài),重新獲得“多潛能性”。這兩項技術(shù)于2012年榮獲諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。iPS技術(shù)的建立,打破了傳統(tǒng)胚胎干細(xì)胞的倫理限制,為構(gòu)建病人自體特異性干細(xì)胞系提供了全新的方法,大大加速了干細(xì)胞臨床應(yīng)用的進(jìn)程。近年來,已開展了針對帕金森、糖尿病和癌癥等多種重點疾病的細(xì)胞治療臨床試驗。然而,目前細(xì)胞治療的技術(shù)體系都是國外發(fā)展起來的,中國能否擁有原創(chuàng)的底層技術(shù)?

長期以來,鄧宏魁團隊一直致力于開發(fā)調(diào)控細(xì)胞命運的新方法和建立制備干細(xì)胞的底層技術(shù)。2013年,鄧宏魁團隊在Science雜志發(fā)表了一項原創(chuàng)性的研究成果,即不依賴卵母細(xì)胞和轉(zhuǎn)錄因子等細(xì)胞內(nèi)源物質(zhì),僅使用外源性化學(xué)小分子就可以逆轉(zhuǎn)細(xì)胞命運,將小鼠體細(xì)胞重編程為多潛能干細(xì)胞(chemically induced pluripotent stem cells,CiPS細(xì)胞)。相比傳統(tǒng)方法,化學(xué)小分子操作簡便靈活,時空調(diào)控性強、作用可逆,可以對細(xì)胞重編程過程進(jìn)行精確操控。另外小分子誘導(dǎo)體細(xì)胞重編程技術(shù)作為非整合方法,規(guī)避了傳統(tǒng)轉(zhuǎn)基因操作引發(fā)的安全問題,有望成為更安全的臨床治療手段。之后,鄧宏魁團隊又相繼在Cell和Cell Stem Cell等雜志發(fā)表文章,詳細(xì)闡明了化學(xué)重編程獨特的分子機理,并進(jìn)一步對小鼠化學(xué)重編程體系進(jìn)行了大幅優(yōu)化。隨后,包括謝欣、姚紅杰、裴端卿、劉林、祝賽勇等多個研究組利用相同或類似的化學(xué)小分子組合,重復(fù)和優(yōu)化了小鼠化學(xué)重編程技術(shù)。化學(xué)重編程誘導(dǎo)多潛能干細(xì)胞的研究開辟了一條全新的體細(xì)胞重編程途徑,不僅有助于更好地理解細(xì)胞命運決定和轉(zhuǎn)變機制,而且為未來再生醫(yī)學(xué)治療重大疾病帶來新的可能。

多潛能干細(xì)胞制備新途徑

本次研究中,鄧宏魁團隊首次報道了使用化學(xué)重編程的方法,成功實現(xiàn)了使用化學(xué)小分子將人成體細(xì)胞誘導(dǎo)為多潛能干細(xì)胞(人CiPS細(xì)胞)。

這一技術(shù)的建立開辟了人多潛能干細(xì)胞制備的全新途徑,使其向臨床應(yīng)用,邁進(jìn)了關(guān)鍵一步。

新一代誘導(dǎo)多潛能干細(xì)胞技術(shù)

作為高等動物,人類成體細(xì)胞特性和穩(wěn)態(tài)調(diào)控的復(fù)雜性遠(yuǎn)非小鼠成體細(xì)胞可比,在表觀遺傳層面上存在重重障礙,嚴(yán)重限制了在人類成體細(xì)胞中激發(fā)細(xì)胞可塑性的可能。自2013年以來,盡管眾多國際團隊在小鼠化學(xué)重編程工作的啟發(fā)下進(jìn)行大量嘗試,卻一直未能解決人類成體細(xì)胞的化學(xué)重編程問題。這使得領(lǐng)域內(nèi)普遍認(rèn)為:人類成體細(xì)胞的表觀遺傳限制是極其嚴(yán)格的,很可能無法通過化學(xué)重編程激發(fā)人類成體細(xì)胞獲得多潛能性。鄧宏魁團隊經(jīng)過長期地堅持和不懈努力,突破了這一瓶頸。這一突破的關(guān)鍵步驟受低等動物再生過程啟發(fā)。蠑螈等低等動物在受到外界損傷后其體細(xì)胞會自發(fā)的改變本身的特性,進(jìn)而通過去分化獲得一定的可塑性,借助這一可塑的中間狀態(tài)實現(xiàn)肢體的再生。沿著這一思路,研究團隊進(jìn)行了大量化學(xué)小分子的篩選和組合,最終發(fā)現(xiàn)高度分化的人成體細(xì)胞在特定的化學(xué)小分子組合的作用下,同樣可以發(fā)生類似去分化的現(xiàn)象,獲得具有一定可塑性的中間狀態(tài)。在此基礎(chǔ)上,研究團隊最終實現(xiàn)了人CiPS細(xì)胞的成功誘導(dǎo)。

人體細(xì)胞化學(xué)重編程誘導(dǎo)人CiPS細(xì)胞

在分子機理上,研究團隊還描繪了化學(xué)重編程誘導(dǎo)人CiPS細(xì)胞的分子路徑,揭示了化學(xué)重編程與傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄因子重編程不同的分子機制和獨特的調(diào)控機理。研究發(fā)現(xiàn)人CiPS的誘導(dǎo)以分階段精確調(diào)控的方式發(fā)生,在早期階段產(chǎn)生了特殊的中間狀態(tài)。通過和低等動物再生去分化過程中細(xì)胞性質(zhì)的詳細(xì)比較,研究團隊確認(rèn)了人CiPS細(xì)胞誘導(dǎo)的早期階段激活了與低等動物斷肢再生早期類似的基因表達(dá)特征。更重要的是,研究團隊還發(fā)現(xiàn)了調(diào)控這一類再生狀態(tài)的關(guān)鍵信號通路,證明抑制過度的炎癥反應(yīng),對于化學(xué)重編程誘導(dǎo)人體細(xì)胞重新獲得類再生中間態(tài)至關(guān)重要。這一再生中間態(tài)為研究人體細(xì)胞重新激活再生基因提供了全新的思路,并且提示將來有僅通過化學(xué)小分子組合重新激活人體細(xì)胞可塑性和再生潛能的可能性,有望推動化學(xué)重編程在組織器官再生方向的應(yīng)用,為再生醫(yī)學(xué)研究提供新的可能途徑。

化學(xué)重編程激活再生相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的分子機制

在臨床轉(zhuǎn)化上,與傳統(tǒng)技術(shù)體系相比,CiPS細(xì)胞誘導(dǎo)技術(shù)更加安全簡單、更易于標(biāo)準(zhǔn)化、更便于精準(zhǔn)調(diào)控。

1)安全性方面,之前在小鼠CiPS細(xì)胞中已經(jīng)證明,其攜帶的遺傳突變顯著少于傳統(tǒng)iPS細(xì)胞,產(chǎn)生的嵌合體小鼠在長達(dá)6個月的觀察期內(nèi)不產(chǎn)生腫瘤且全部健康存活。同時,人CiPS細(xì)胞分化來源的胰島細(xì)胞移植入小鼠和非人靈長類動物模型體內(nèi),經(jīng)過長期觀察未發(fā)現(xiàn)腫瘤形成;

2)在個體化制備方面,研究團隊目前已在不同年齡個體來源的體細(xì)胞類型上都可實現(xiàn)穩(wěn)定誘導(dǎo)人CiPS細(xì)胞;

3)在細(xì)胞標(biāo)準(zhǔn)化制備方面,化學(xué)小分子具有操作簡單,時空調(diào)控性強,作用可逆,合成儲存方便,易于標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)等一系列特點,使得人CiPS細(xì)胞在標(biāo)準(zhǔn)化和規(guī)模化生產(chǎn)方面有著不可替代的優(yōu)勢。

CiPS細(xì)胞技術(shù)的這些優(yōu)勢突破了傳統(tǒng)干細(xì)胞制備技術(shù)面臨的限制,具有廣闊的臨床應(yīng)用前景。

助力解決重大疾病難題

與此同時,鄧宏魁團隊還對CiPS細(xì)胞和化學(xué)重編程在醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化上的潛力展開積極探索,比如研究CiPS細(xì)胞技術(shù)在治療糖尿病上的可行性。

目前,該團隊已經(jīng)獨立開發(fā)了CiPS細(xì)胞向胰島組織分化的高效方案,在體外可以獲得功能成熟的胰島細(xì)胞 (CiPS-胰島細(xì)胞),并在靈長類動物模型里系統(tǒng)評價了CiPS-胰島細(xì)胞治療糖尿病的安全性和有效性。研究團隊觀察到,接受CiPS-胰島細(xì)胞移植的糖尿病猴的C肽(胰島素分泌標(biāo)記物)釋放能夠響應(yīng)餐食或葡萄糖刺激。此外,在4只長期跟蹤觀察的糖尿病模型猴上,糖化血紅蛋白(HbA1c)這一臨床常用的指標(biāo)與移植前峰值相比,下降了2%以上,說明血糖得到有效控制。這些結(jié)果證明了CiPS-胰島細(xì)胞在糖尿病治療中的安全性和有效性,凸顯了人CiPS細(xì)胞作為“種子細(xì)胞”治療重大疾病的巨大優(yōu)勢。這一研究的主要結(jié)果于今年二月發(fā)表在醫(yī)學(xué)雜志NatureMedicine上。

另一方面,鄧宏魁團隊還對“化學(xué)重編程”這一化學(xué)生物學(xué)概念的普適性進(jìn)行了大量研究,未來有望助力解決重大醫(yī)學(xué)難題。該團隊已經(jīng)利用化學(xué)小分子實現(xiàn)了不同體細(xì)胞類型間的轉(zhuǎn)變,直接將皮膚細(xì)胞重編程為功能神經(jīng)元(Cell Stem Cell, 2015;Cell Stem Cell, 2017);建立了具有細(xì)胞發(fā)育全能性功能特征的EPS細(xì)胞(Cell,2017);解決了肝臟細(xì)胞功能在體外難以長期維持的難題(Science,2019);構(gòu)建了能模擬腸道損傷且具有能再生能力的新型類器官模型(CellResearch, 2021);實現(xiàn)了體內(nèi)原位化學(xué)重編程,在小鼠顱內(nèi)將膠質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化為神經(jīng)元(CellDiscovery, 2021)。這一系列工作體現(xiàn)了化學(xué)小分子調(diào)控細(xì)胞命運的普適性和化學(xué)重編程技術(shù)應(yīng)對重大醫(yī)學(xué)需求的潛力。

圖 人CiPS技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有廣闊的潛在應(yīng)用前景

綜上所述,化學(xué)重編程技術(shù)體系的建立不僅在多潛能干細(xì)胞臨床應(yīng)用領(lǐng)域具有巨大的意義和價值,同時為細(xì)胞命運調(diào)控及再生生物學(xué)理論研究方面提供了全新的視角和平臺。化學(xué)重編程可以精確調(diào)控細(xì)胞命運,有望成為高效制備各種功能細(xì)胞類型的通用技術(shù),為治療重大疾病開辟了新的途徑。

北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、北大-清華生命聯(lián)合中心鄧宏魁教授領(lǐng)導(dǎo)了此項研究。鄧宏魁教授,北京大學(xué)王金琳博士和中國人民解放軍總醫(yī)院盧實春教授是這一研究成果的共同通訊作者。北京大學(xué)關(guān)景洋,王冠,王金琳,張正元,傅瑤,成林,孟高帆,呂鈺麟為該研究成果的主要作者。北京大學(xué)李程教授為該研究的生物信息分析提供了重要指導(dǎo)。本工作獲得了北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心、國家重點研發(fā)計劃項目、國家自然科學(xué)基金等支持。

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